LX90LNTを使っておりましたが、まず時刻に関しては、LNTモジュールをあけて電池がきちんと収まっているのか確認するべきだと思います。通常1年くらいだと電池はなくならないはずですので。

次にアライメントの精度ですが、基本的に経緯台式ではLNTといえどいかに正確に水平台を行うかが重要です。フォーク架台の中央に水準器を角度をかえてあてて、なるべく水平になるようにしてみてください。その後LNT付きだと一周し磁北を検出してもっとも
明るそうな星を指定して向けますが、電池が収まっていて、かつ水平がでていたけれどずれる場合は、磁北センサーが、磁化により原点がずれている場合があります。これは今のところASでは、
キャリブレーションをして初期値を変えるすべがないため、どうしようもありません。所詮2スターですので、最初のアライメントは手動であわせると次の星は、位置計算でファインダーでのぞいてはいるくらいの精度にならないとおかしいです。

アライメント時はできるかぎり80倍以上の高い倍率で中央にいれてみてください。

それでもだめなら修理にだしたほうがよいかもしれません。