１　ETXのアライメント
　まず、ズレていますので普通だと思います。
　初めから、ズレてなければアライメントする必要はないじゃないですか。普通はズレているはずです。大きくズレていれば設定の問題も考えられますが。日時、時刻、観測地等がきちんと設定されていることが前提です。
　ずれている場合は、近くの星が選ばれた基準星であることを確認できればそれであわせるといいと思います。
　

２　視力と合焦
　裸眼でピントを合わせても、眼鏡をかければその分ピントはズレます。　覗く人によってもピントはズレます。
　

３　プレアデス星団の撮影について（追加）
①撮りたい画角に合わせてください。どちらが良いというものでは無いと思います。

②カメラファインダーでプレアデス星団はきれいに見えますよ。
　ピントが合ってないか、拡大しすぎて見えていないか。ではないでしょうか？

③カメラで撮るのでしたら、そのカメラのファインダーで覗いてピントを合わせるべきでしょう。そして実際に撮影して確認するのがいいでしょう。kiss F でしたらライブビューがあると思うので１０倍に拡大してピント合わせたらいいのではないでしょうか？そのときは液晶画面の明るさをある程度あげなければなにも見えません。

④300mmF5.6望遠レンズの性能によります。ED45Ⅱより良いやつは良いでしょうし。悪いのは悪い。
画角が同じなら、レンズの違いによる収差の具合や口径の違いによる光量、分解能の違いくらいではないでしょうか？
プレアデス星団を撮るにあたって大きな違いは無いように思えますが。
撮影場所、条件（光害地、シーイング）が一番、写真の出来に影響すると思います。良いレンズや機材でも撮影条件が悪ければ良いのは撮れません。


撮れた写真は、是非upしてくださいね。